由于感染的部位不同，发作的性质、预后及治疗方案均不同，因此区分上、下尿路感染，即鉴别尿路感染的部位有着重要的意义。

传统的观点是以临床症状和体征作为鉴别感染部位的依据。如仅有尿路刺激症状和真性细菌尿者被认为是膀胱炎；有尿路刺激症状、真性细菌尿、肾区压痛及叩击痛，或伴有腰痛和发热者就认为是肾盂肾炎。这种方法既方便简单，又实用性强。但临床上，有不少肾盂肾炎患者以尿频、排尿不适为主，无其他尿路感染症状；膀胱炎患者有时亦可出现腰痛，少数病人有低热。故仅靠临床症状和体征难以作出正确定位诊断。这种简单的区分上、下尿路感染的方法仅供临床上参考，欲准确地作出定位诊断，必须依靠实验室检查。

临床上，较常用的还有下面一种鉴别方法：以尿频、尿急、尿痛为主症的生育年龄妇女，先予单剂或3日疗法，如能，则多为膀胱炎；如停止治疗1月内复发（大多数在1～2周内复发），则多为肾盂肾炎。这种治疗性定位方法的准确性可达80%。