本病应与膀胱颈挛缩(Marion氏病)、神经病原性膀胱、膀胱肿瘤、前列腺结核、前列腺结石、前列腺囊肿、输尿管间嵴肥大、结石、异物等相鉴别。
1.膀胱颈挛缩 膀胱颈挛缩继发于炎症病变。膀胱颈口平滑肌为结缔组织所代替，亦可能是发育过程中膀胱颈部肌肉排列异常，以致膀胱逼尿肌收缩时颈部不能开放。膀胱镜检查时，膀胱颈后唇抬高，后尿道与膀胱三角区收缩变短。
2.前列腺癌 前列腺有结节，PSA>4ng/ml，经直肠超声可见前列腺内低回声区。CT可见前列腺形状不规则,膀胱精囊角消失,精囊形状发生变化。活检可证实。
3.神经病源性膀胱 各年龄段均可发生，有明显的神经系统损害的病史和体征，往往同时存在有下肢感觉和运动障碍，有时伴有肛门括约肌松弛和反射消失。直肠指检前列腺不大，尿动力学检查可进行鉴别。
4.尿道狭窄 多有尿道损伤、感染等病史。

血清硷性磷酸酶测定：当有骨转移时，血清硷性磷酸酶为升高。
前列腺活检：经会阴或直肠均可进行前列腺穿刺活检。
精囊射精管造影：前列腺肥大仅可见有对称性的扩大，边缘整齐，多见狭窄、不规则、边缘不齐、或缺损。